MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017998	AGAAA	2	10	15	24	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017998	TAA	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017998	AAG	2	6	47	52	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017998	ATT	2	6	63	68	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017998	AAG	2	6	74	79	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017998	TAA	2	6	83	88	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017998	TCC	2	6	284	289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017998	ATA	2	6	1342	1347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017998	ACAT	2	8	1490	1497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017998	A	6	6	1511	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017998	TAAA	2	8	2669	2676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017998	CAC	2	6	2680	2685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017998	TCC	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017998	TC	3	6	3501	3506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017998	TAAT	2	8	3511	3518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017998	TAA	2	6	3523	3528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017998	AT	3	6	3575	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017998	AT	3	6	3595	3600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017998	A	6	6	3601	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017998	A	7	7	3608	3614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017998	AT	3	6	3655	3660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017998	ATTA	2	8	4602	4609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017998	TAAT	2	8	4610	4617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017998	AAT	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017998	TA	3	6	4642	4647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017998	AT	3	6	4668	4673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017998	AT	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017998	AAAAC	2	10	4695	4704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017998	A	8	8	4739	4746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017998	TA	3	6	4754	4759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017998	TA	3	6	6458	6463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017998	TCC	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017998	CCT	2	6	11844	11849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017998	A	6	6	11855	11860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017998	TA	3	6	12966	12971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017998	A	8	8	12979	12986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017998	A	7	7	12988	12994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017998	TTA	2	6	13006	13011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017998	TCC	2	6	14015	14020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017998	A	6	6	14024	14029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017998	TCC	2	6	14822	14827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017998	CCT	2	6	14864	14869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017998	T	7	7	14869	14875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017998	A	7	7	14880	14886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017998	TATT	2	8	14916	14923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017998	AAT	2	6	14952	14957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017998	AATA	2	8	14998	15005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017998	TAAA	2	8	15045	15052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017998	AAT	2	6	15060	15065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017998	TAA	2	6	15087	15092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017998	ATTCAT	2	12	15095	15106	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017998	TTA	2	6	15134	15139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017998	TAT	2	6	15168	15173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017998	ATA	2	6	15176	15181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017998	ATTT	3	12	15251	15262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017998	TAAA	2	8	15302	15309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017998	ATA	2	6	15310	15315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017998	ATT	2	6	15333	15338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017998	CAT	2	6	15344	15349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017998	CAT	2	6	15366	15371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017998	T	6	6	15388	15393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017998	TTG	2	6	15532	15537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017998	ATA	2	6	15558	15563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017998	TA	3	6	15562	15567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017998	T	9	9	15584	15592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017998	GAA	2	6	15640	15645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017998	ATA	2	6	15647	15652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017998	ATA	3	9	15675	15683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017998	TTA	2	6	15713	15718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017998	ATC	2	6	18437	18442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017998	A	6	6	19435	19440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017998	CCT	2	6	19468	19473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017998	CCT	2	6	19823	19828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017998	TAA	2	6	19837	19842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017998	T	6	6	19849	19854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017998	CCT	2	6	19864	19869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017998	A	6	6	19878	19883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017998	TA	3	6	19892	19897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017998	A	6	6	19927	19932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017998	CATT	2	8	19949	19956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017998	TAC	2	6	21428	21433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017998	GTAT	2	8	21435	21442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017998	TTGCA	2	10	21443	21452	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017998	AT	3	6	21458	21463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017998	AGT	2	6	21512	21517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017998	ATA	2	6	21518	21523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017998	TA	3	6	21541	21546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017998	T	6	6	21559	21564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017998	ACA	2	6	21572	21577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017998	GCT	2	6	21592	21597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017998	TA	3	6	21598	21603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017998	AGA	2	6	21604	21609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017998	T	8	8	21640	21647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017998	A	7	7	21649	21655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017998	TA	3	6	21656	21661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017998	TCC	2	6	22626	22631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017998	AT	3	6	22639	22644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017998	AAT	2	6	22696	22701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017998	GCT	2	6	22807	22812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017998	TAAA	2	8	22815	22822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017998	TCT	2	6	22878	22883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017998	TCC	2	6	22906	22911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017998	ATC	2	6	22918	22923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017998	ATT	2	6	22952	22957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017998	GTT	2	6	23027	23032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017998	GTT	3	9	23080	23088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017998	TAT	2	6	24391	24396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017998	GTTT	2	8	24451	24458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017998	T	6	6	24468	24473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017998	ACA	2	6	24474	24479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017998	A	6	6	24481	24486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017998	TAAAC	2	10	24553	24562	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017998	TCC	2	6	25035	25040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017998	TAA	2	6	25055	25060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017998	A	6	6	25059	25064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017998	TATAAT	2	12	25070	25081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017998	T	6	6	25088	25093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017998	ATGT	2	8	25104	25111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017998	ACAT	2	8	25124	25131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017998	TC	3	6	25136	25141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017998	TC	3	6	25530	25535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017998	ATAAAA	2	12	25542	25553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017998	ATA	2	6	25597	25602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017998	ATT	2	6	25615	25620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017998	ATA	2	6	25633	25638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017998	AAAAT	2	10	25657	25666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017998	TTA	2	6	25695	25700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017998	TCC	2	6	26854	26859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017998	AGGA	2	8	28437	28444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017998	TC	3	6	28848	28853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017998	CCT	2	6	29677	29682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017998	AAT	2	6	29707	29712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017998	CCT	2	6	30003	30008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017998	A	6	6	30422	30427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017998	AGAA	2	8	30435	30442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017998	ATT	2	6	30465	30470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017998	ATT	2	6	30500	30505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017998	TA	3	6	30510	30515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017998	ATA	3	9	30513	30521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017998	CCT	2	6	30912	30917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017998	A	6	6	30934	30939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017998	T	6	6	30941	30946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017998	TCA	2	6	30953	30958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017998	AAAT	2	8	30975	30982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017998	T	6	6	31000	31005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017998	TCA	2	6	31047	31052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017998	A	6	6	31094	31099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017998	ATG	2	6	31250	31255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017998	CTT	2	6	31310	31315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017998	TCT	2	6	31329	31334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017998	TGTT	2	8	31444	31451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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